תיכון מסע מציע מסע חברתי וקהילתי המושתת על שותפות ואחריות בקהילה, המתבטא במספר מעגלים משמעותיים:
תוכנית האקו-סיסטם מבטאת את האמונה בחיבור עמוק בין הלמידה לקהילה ולמציאות החיים בירושלים. התלמידים חווים למידה משמעותית דרך שיתופי פעולה ייחודיים עם מוסדות מובילים בעיר, כמו בית הלוחם, הדסה עין כרם והאוניברסיטה העברית. בכל שנה מתמקדים במוסד ירושלמי אחר, כך שהתלמידים מפתחים תחושת שייכות למספר מוסדות בעיר.

הלמידה משלבת מפגש חי עם התחום הנלמד, עבודת חקר אישית או קבוצתית, עשייה קהילתית משמעותית, ואירועי שיא במוסדות השונים.
עיקרון מרכזי בתיכון הוא "כל תלמיד חבר צוות". התלמידים לוקחים חלק פעיל בהובלת בית הספר דרך מרחבי שותפות ואחריות בתחומים החברתיים, הרוחניים, הפדגוגיים והקהילתיים. כל התלמידים משויכים לצוותים ומקדישים שעה שבועית ללמידת מיומנויות, עבודה משותפת והכשרה. התהליך מלווה במשוב, רפלקציה והערכה מתמדת, המאפשרים צמיחה אישית ופיתוח מיומנויות הובלה, קבלת החלטות, עבודת צוות וניהול.
החוויה החברתית בתיכון היא אינטנסיבית וכוללת שבועות שיא של חוויה לימודית בהובלת תלמידים וצוות, אירועים קהילתיים שבועיים, ריצה בית ספרית ועבודה קבוצתית-חברתית קבועה. כל אלה יוצרים תחושה מתמדת של מסע משותף תחת נושא וסיפור מאחד.

לבסוף, תיכון מסע שם דגש על יצירת חיבורים בחברה הישראלית. זאת דרך מיזם 'קהילות מחוברות' המקיים קשר קבוע עם תיכון ממלכתי בעיר, אירוח קבוע של דמויות משמעותיות ממגוון החברה הישראלית והירושלמית, ומפגשים עם עמדות וגישות מגוונות בלמידה. מטרת התוכנית היא לפתח בקרב התלמידים תחושת אחריות לעתיד משותף במדינה יהודית ודמוקרטית, תוך טיפוח סקרנות, אמון, הקשבה וכבוד לדעות שונות.